صنعت جوجه کشی نیز به عنوان یک فعالیت مهم در صنعت آبزی‌پروری در ایران شناخته می‌شود. در این صنعت، جوجه‌های ماهیان سردابی و گرمابی تولید و پرورش می‌دهند.
جوجه کشی ماهیان سردابی در ایران به دلیل شرایط آب و هوایی مناسب و وجود منابع آبی فراوان، به خوبی انجام می‌شود. این صنعت دارای مزایای زیادی است که شامل تأمین نیازهای داخلی به جوجه ماهی، کاهش وابستگی به واردات، افزایش تولید و بهبود اقتصاد کشور است.
دولت و سازمان‌های مربوطه در ایران سعی دارند با ارائه تسهیلات و پشتیبانی‌های لازم، صنعت جوجه کشی را توسعه دهند و به بهبود شرایط اقتصادی و اجتماعی کشور کمک کنند. همچنین، تحقیقات و آموزش‌های لازم نیز در این زمینه انجام می‌شود تا کیفیت و عملکرد جوجه‌های تولید شده بهبود یابد.